Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1bB9EJ57 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1bB9EJ57 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms