Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms