Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm436B1AVU6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm436B1AVU6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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