Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms