Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Xlr4aA2BI40 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xlr4aA2BI40 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms