Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r2A2AMT6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms