Protein–RNA interactions for Protein: A2A7V7

Cd300c, CMRF35-like molecule 6, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300cA2A7V7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300cA2A7V7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300cA2A7V7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms