Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms