Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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