Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxd11P23813 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxd11P23813 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms