Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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