Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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CCDC142Q17RM4 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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CCDC142Q17RM4 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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CCDC142Q17RM4 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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CCDC142Q17RM4 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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CCDC142Q17RM4 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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CCDC142Q17RM4 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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CCDC142Q17RM4 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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CCDC142Q17RM4 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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