Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SS18Q15532 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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