Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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