Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms