Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms