Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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