Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 GYG1P2-201ENST00000426437 1006 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 LRP4-AS1-202ENST00000531719 731 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC013489.3-201ENST00000623274 517 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HLA-DMAP28067 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms