Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms