Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms