Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms