Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RNU1-4-201ENST00000384659 164 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 RNU1-3-201ENST00000384782 164 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC084880.1-201ENST00000392530 545 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 MICU1-203ENST00000398763 1224 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 BRCC3-206ENST00000399042 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 HIST1H2BPS2-201ENST00000402707 340 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL590133.1-201ENST00000412838 368 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC245452.3-201ENST00000413294 162 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC006195.1-201ENST00000423599 923 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC016027.1-201ENST00000426483 805 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 LINC00158-203ENST00000440205 740 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 MTND6P15-201ENST00000441157 521 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AP000290.1-201ENST00000450830 449 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC020595.1-201ENST00000456446 533 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 RN7SL370P-201ENST00000470869 295 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 LINC02004-201ENST00000482019 294 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 RN7SL316P-201ENST00000483452 272 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC146949.1-201ENST00000505946 423 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 GUSBP3-201ENST00000509348 423 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC091965.1-201ENST00000512406 440 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC144568.2-201ENST00000522481 944 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC092471.1-201ENST00000536497 572 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 MORN5-205ENST00000536616 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 TSPAN8-203ENST00000546561 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC078865.1-201ENST00000547174 562 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ARL17A-204ENST00000570550 491 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ARL17B-204ENST00000571246 491 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 PRR13P4-201ENST00000577786 421 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 TBC1D29-201ENST00000579181 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AA06-201ENST00000579745 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC006213.3-201ENST00000586247 517 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC020905.1-201ENST00000587777 575 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL356299.2-201ENST00000609218 586 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL359198.1-201ENST00000610263 571 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 OR4E1-201ENST00000610316 900 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 U1.40-201ENST00000610976 164 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL513479.1-201ENST00000611376 585 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 U1.27-201ENST00000615842 164 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 BRCC3-210ENST00000630295 954 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL021920.3-201ENST00000633433 819 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC108099.1-201ENST00000564402 3258 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms