Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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SS18Q15532 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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