Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ubl3Q9Z2M6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ubl3Q9Z2M6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ubl3Q9Z2M6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ubl3Q9Z2M6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubl3Q9Z2M6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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