Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms