Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oc90Q9Z0L3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms