Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap4s1Q9WVL1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms