Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc6Q9R087 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc6Q9R087 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms