Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms