Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cln8Q9QUK3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms