Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col5a3Q9JLI2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms