Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Gde1Q9JL56 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Gde1Q9JL56 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Gde1Q9JL56 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gde1Q9JL56 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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