Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chrac1Q9JKP8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms