Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms