Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbr1Q9JIT0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms