Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Praf2Q9JIG8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms