Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cldn19Q9ET38 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Cldn19Q9ET38 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn19Q9ET38 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Cldn19Q9ET38 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Cldn19Q9ET38 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Cldn19Q9ET38 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Cldn19Q9ET38 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Cldn19Q9ET38 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Cldn19Q9ET38 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms