Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrnb2Q9ERK7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms