Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr61Q9ERF3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms