Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slco1c1Q9ERB5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms