Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms