Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmg20aQ9DC33 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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