Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms