Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms