Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scp2d1Q9DAH1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scp2d1Q9DAH1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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