Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smco2Q9DA21 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smco2Q9DA21 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms