Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms