Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8N1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8N1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8N1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8N1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8N1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8N1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8N1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8N1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8N1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8N1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8N1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8N1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8N1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8N1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8N1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8N1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8N1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8N1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8N1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms