Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms