Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ribc2Q9D4Q1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ribc2Q9D4Q1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms